脈沖除塵器根據其除塵器的大小有好幾組脈沖閥，全部由脈沖控制儀或者是PLC控制，所以這也就使得脈沖除塵器可以 邊工作 邊除塵。

脈沖除塵器除塵每次打開 組脈沖閥的時候，可以用其來除去它所控制的那部分過濾介質（濾袋或濾筒）的粉塵，而不打開脈沖閥的布袋或濾筒則可以正常工作。每隔 段時間后就可以進行更換，打開另 組脈沖閥，讓剛才工作的那組脈沖閥進行休息。

脈沖除塵器工作的時候，含塵氣體由進風道進入灰斗里面，粗徑粉塵粒可以直接掉落在灰斗的底部，而細徑粉塵粒則隨氣流轉折，向上進入中箱體和下箱體，過濾的粉塵直接積附在濾袋的外表面，過濾后的氣體則直接進入上箱體 直到凈氣集合管排風道，經由排風機排到大氣當中。